Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp4cQ9D7F7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms