Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bl1Q9D701 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3bl1Q9D701 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms