Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms