Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rab11fip1Q9D620 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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