Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms