Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ubxn11Q9D572 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ubxn11Q9D572 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn11Q9D572 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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