Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata17Q9D552 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms