Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms