Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms