Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms