Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam90a1bQ9D4F3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms