Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms