Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms