Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933425L06RikQ9D3Z8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms