Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms