Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms