Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms