Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D3J9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms