Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stag1Q9D3E6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms