Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms