Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z1

Ceacam20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam20Q9D2Z1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam20Q9D2Z1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ceacam20Q9D2Z1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms