Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms