Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms