Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms