Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms