Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms