Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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