Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms