Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms