Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp23Q9CX11 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms