Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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