Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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