Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms