Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard3bQ9CSB4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard3bQ9CSB4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms