Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms