Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifitm3Q9CQW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms