Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms