Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms