Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp6v0e1Q9CQD8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp6v0e1Q9CQD8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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