Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms