Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mid1ip1Q9CQ20 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms