Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms