Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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