Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims1Q99NE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rims1Q99NE5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms