Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms