Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl43Q99N89 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mrpl43Q99N89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mrpl43Q99N89 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mrpl43Q99N89 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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