Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms