Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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