Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms