Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms